著作權是知識產權中的例外，因為著作權的取得無須經過個別確認，這就是人們常說的“自動保護”原則。軟件經過登記后，軟件著作權人享有發表權、開發者身份權、使用權、使用許可權和獲得報酬權。
申請軟件著作權還有很多作用：
《軟件著作權登記證書》是企業在申請高新技術企業認定時非常重要的砝碼，有了軟件著作權登記證書在一定程度上就能證明企業擁有核心自主知識產權的證明
4、《軟件著作權登記證書》是企業申請軟件企業必不可少的證明材料。
5、從以上3、4點可以看出，軟件著作權登記證書也是企業獲得國家稅收減免、人才優惠等國家政策的條件。
6．在廈門有的行政區域申請軟件著作權達到一定數量還會有資金的補助獎勵政策。

軟件著作權登記的申請流程

"計算機程序和有關文擋。.計算機程序包括：源程序和目標程序。同一程序的源文本和目標文本應視為同一作品。.文擋：程序設計說明書、流程圖、用戶手冊等
　提交作品——版權委托書——提交（營業執照復印件、身份證復印件）——交費——受理——審查——證書（2個月）